Der Finanzbereich bearbeitet alle Vorgänge, die in einem Unternehmen entstehen und in Geschäftsvorfälle (Soll und Haben) in Zahlen übersetzt anfallen. D.h. Erlöse werden verbucht und der Zahlungseingang wird erfasst und überwacht. Eingangsrechnungen werden digitalisiert und nach Prüfung und Freigabe verbucht, dann bezahlt. 

Er ist in Teilen dezentral aufgestellt. Besteht aus der klassischen Einteilung aus Debitoren-, Kreditoren- und Hauptbuchhaltung. Die Debitorenbuchhaltungen sind in den Standorten vertreten, um die Nähe zu den Geschäftsvorfällen vor Ort zu halten. Die Kreditoren- und Hauptbuchhaltung sind zentralisiert. 

Die Mitarbeitenden des Controllings sind die (betriebs-) wirtschaftliche*r Berater*innen der Entscheider*innen auf den verschiedenen Ebenen, z.B. Vorstand, Geschäftsführungen, Direktor*innen etc.

Die wesentlichen Aufgaben des Controlling sind die Erstellung des Wirtschaftsplanes MKK und AVK, das Monitoren der Abweichungen im Rahmen der Erfolgsrechnungen und Quartalsberichte, die Begleitung der Zielvereinbarungen zwischen den Geschäftsführungen und Direktor*innen, die Verhandlungen und Vereinbarungen mit den Sozialleistungsträgern, das innerbetriebliche Berichtswesen, die Kosten- und Leistungsrechnung sowie betriebswirtschaftliche Sonderaufgaben wie z.B. Businesspläne und Kalkulation von klinischen Studien. 

 In den Mühlenkreiskliniken arbeiten die Controller*innen stark vernetzt sowohl zentral als auch dezentral an den verschiedenen Standorten. Mit dem Medizin- und Personalcontrolling besteht eine enge inhaltliche und kooperative Zusammenarbeit.

Das Finanzmanagement ist Ansprechpartner für alle Finanzierungsinstitutionen und übernimmt unter anderem die Liquiditätsplanung und Analyse der Soll-Ist-Abweichungen, die Finanzmitteldisposition, Kreditmittelaufnahmen und -rückzahlungen, Termingeldanlagen, Abschluss und Betreuung von Leasingverträgen, Erstellung von Statistiken und Auswertungen zu Finanzdaten, Beobachtung des Kapitalmarktes sowie weitere Sonderaufgaben.